Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6A2

CYP46A1, Cholesterol 24-hydroxylase, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP46A1Q9Y6A2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CYP46A1Q9Y6A2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
CYP46A1Q9Y6A2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
CYP46A1Q9Y6A2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CYP46A1Q9Y6A2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CYP46A1Q9Y6A2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CYP46A1Q9Y6A2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CYP46A1Q9Y6A2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CYP46A1Q9Y6A2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CYP46A1Q9Y6A2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CYP46A1Q9Y6A2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CYP46A1Q9Y6A2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CYP46A1Q9Y6A2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CYP46A1Q9Y6A2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CYP46A1Q9Y6A2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CYP46A1Q9Y6A2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CYP46A1Q9Y6A2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CYP46A1Q9Y6A2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CYP46A1Q9Y6A2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CYP46A1Q9Y6A2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CYP46A1Q9Y6A2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CYP46A1Q9Y6A2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP46A1Q9Y6A2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP46A1Q9Y6A2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP46A1Q9Y6A2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP46A1Q9Y6A2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP46A1Q9Y6A2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP46A1Q9Y6A2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP46A1Q9Y6A2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP46A1Q9Y6A2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYP46A1Q9Y6A2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYP46A1Q9Y6A2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYP46A1Q9Y6A2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYP46A1Q9Y6A2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYP46A1Q9Y6A2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYP46A1Q9Y6A2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYP46A1Q9Y6A2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYP46A1Q9Y6A2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYP46A1Q9Y6A2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYP46A1Q9Y6A2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYP46A1Q9Y6A2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYP46A1Q9Y6A2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYP46A1Q9Y6A2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYP46A1Q9Y6A2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYP46A1Q9Y6A2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYP46A1Q9Y6A2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYP46A1Q9Y6A2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYP46A1Q9Y6A2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP46A1Q9Y6A2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP46A1Q9Y6A2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP46A1Q9Y6A2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP46A1Q9Y6A2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP46A1Q9Y6A2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP46A1Q9Y6A2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms