Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G5

PCDHGA8, Protocadherin gamma-A8, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGA8Q9Y5G5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGA8Q9Y5G5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGA8Q9Y5G5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGA8Q9Y5G5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGA8Q9Y5G5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGA8Q9Y5G5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGA8Q9Y5G5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGA8Q9Y5G5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGA8Q9Y5G5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGA8Q9Y5G5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGA8Q9Y5G5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGA8Q9Y5G5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGA8Q9Y5G5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHGA8Q9Y5G5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHGA8Q9Y5G5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHGA8Q9Y5G5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHGA8Q9Y5G5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHGA8Q9Y5G5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHGA8Q9Y5G5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHGA8Q9Y5G5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHGA8Q9Y5G5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHGA8Q9Y5G5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHGA8Q9Y5G5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHGA8Q9Y5G5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHGA8Q9Y5G5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHGA8Q9Y5G5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHGA8Q9Y5G5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHGA8Q9Y5G5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHGA8Q9Y5G5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHGA8Q9Y5G5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHGA8Q9Y5G5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHGA8Q9Y5G5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHGA8Q9Y5G5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHGA8Q9Y5G5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHGA8Q9Y5G5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHGA8Q9Y5G5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHGA8Q9Y5G5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHGA8Q9Y5G5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHGA8Q9Y5G5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHGA8Q9Y5G5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHGA8Q9Y5G5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHGA8Q9Y5G5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHGA8Q9Y5G5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHGA8Q9Y5G5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHGA8Q9Y5G5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHGA8Q9Y5G5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHGA8Q9Y5G5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHGA8Q9Y5G5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHGA8Q9Y5G5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHGA8Q9Y5G5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHGA8Q9Y5G5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHGA8Q9Y5G5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHGA8Q9Y5G5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHGA8Q9Y5G5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHGA8Q9Y5G5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHGA8Q9Y5G5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHGA8Q9Y5G5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHGA8Q9Y5G5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHGA8Q9Y5G5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHGA8Q9Y5G5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHGA8Q9Y5G5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHGA8Q9Y5G5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHGA8Q9Y5G5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHGA8Q9Y5G5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHGA8Q9Y5G5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHGA8Q9Y5G5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHGA8Q9Y5G5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHGA8Q9Y5G5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHGA8Q9Y5G5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHGA8Q9Y5G5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHGA8Q9Y5G5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHGA8Q9Y5G5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHGA8Q9Y5G5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHGA8Q9Y5G5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHGA8Q9Y5G5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHGA8Q9Y5G5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHGA8Q9Y5G5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHGA8Q9Y5G5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHGA8Q9Y5G5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHGA8Q9Y5G5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHGA8Q9Y5G5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHGA8Q9Y5G5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHGA8Q9Y5G5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms