Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y375

NDUFAF1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF1Q9Y375 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAF1Q9Y375 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAF1Q9Y375 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAF1Q9Y375 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAF1Q9Y375 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAF1Q9Y375 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAF1Q9Y375 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAF1Q9Y375 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NDUFAF1Q9Y375 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NDUFAF1Q9Y375 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDUFAF1Q9Y375 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms