Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y215

COLQ, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLQQ9Y215 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COLQQ9Y215 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COLQQ9Y215 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COLQQ9Y215 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms