Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SAMD4AQ9UPU9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAMD4AQ9UPU9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAMD4AQ9UPU9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMD4AQ9UPU9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMD4AQ9UPU9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMD4AQ9UPU9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMD4AQ9UPU9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMD4AQ9UPU9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAMD4AQ9UPU9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAMD4AQ9UPU9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAMD4AQ9UPU9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAMD4AQ9UPU9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAMD4AQ9UPU9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAMD4AQ9UPU9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAMD4AQ9UPU9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAMD4AQ9UPU9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAMD4AQ9UPU9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAMD4AQ9UPU9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAMD4AQ9UPU9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMD4AQ9UPU9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMD4AQ9UPU9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMD4AQ9UPU9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMD4AQ9UPU9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMD4AQ9UPU9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMD4AQ9UPU9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMD4AQ9UPU9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMD4AQ9UPU9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMD4AQ9UPU9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMD4AQ9UPU9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMD4AQ9UPU9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMD4AQ9UPU9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMD4AQ9UPU9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMD4AQ9UPU9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMD4AQ9UPU9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMD4AQ9UPU9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAMD4AQ9UPU9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAMD4AQ9UPU9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAMD4AQ9UPU9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAMD4AQ9UPU9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAMD4AQ9UPU9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAMD4AQ9UPU9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAMD4AQ9UPU9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms