Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXD3Q9UJU5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FOXD3Q9UJU5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
FOXD3Q9UJU5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD3Q9UJU5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD3Q9UJU5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD3Q9UJU5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD3Q9UJU5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD3Q9UJU5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD3Q9UJU5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD3Q9UJU5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD3Q9UJU5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD3Q9UJU5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD3Q9UJU5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXD3Q9UJU5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXD3Q9UJU5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXD3Q9UJU5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXD3Q9UJU5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FOXD3Q9UJU5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FOXD3Q9UJU5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms