Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
MLH3Q9UHC1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
MLH3Q9UHC1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
MLH3Q9UHC1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
MLH3Q9UHC1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
MLH3Q9UHC1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC35.14■■■■□ 3.22
MLH3Q9UHC1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
MLH3Q9UHC1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
MLH3Q9UHC1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
MLH3Q9UHC1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
MLH3Q9UHC1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
MLH3Q9UHC1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
MLH3Q9UHC1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
MLH3Q9UHC1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
MLH3Q9UHC1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
MLH3Q9UHC1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
MLH3Q9UHC1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
MLH3Q9UHC1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
MLH3Q9UHC1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
MLH3Q9UHC1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC35.11■■■■□ 3.21
MLH3Q9UHC1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
MLH3Q9UHC1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
MLH3Q9UHC1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
MLH3Q9UHC1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
MLH3Q9UHC1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
MLH3Q9UHC1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
MLH3Q9UHC1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
MLH3Q9UHC1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
MLH3Q9UHC1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
MLH3Q9UHC1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
MLH3Q9UHC1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
MLH3Q9UHC1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
MLH3Q9UHC1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
MLH3Q9UHC1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
MLH3Q9UHC1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
MLH3Q9UHC1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
MLH3Q9UHC1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
MLH3Q9UHC1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
MLH3Q9UHC1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
MLH3Q9UHC1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
MLH3Q9UHC1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
MLH3Q9UHC1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
MLH3Q9UHC1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
MLH3Q9UHC1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
MLH3Q9UHC1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
MLH3Q9UHC1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
MLH3Q9UHC1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
MLH3Q9UHC1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
MLH3Q9UHC1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
MLH3Q9UHC1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
MLH3Q9UHC1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
MLH3Q9UHC1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
MLH3Q9UHC1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
MLH3Q9UHC1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
MLH3Q9UHC1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
MLH3Q9UHC1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
MLH3Q9UHC1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
MLH3Q9UHC1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
MLH3Q9UHC1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
MLH3Q9UHC1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
MLH3Q9UHC1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
MLH3Q9UHC1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
MLH3Q9UHC1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
MLH3Q9UHC1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
MLH3Q9UHC1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
MLH3Q9UHC1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
MLH3Q9UHC1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
MLH3Q9UHC1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
MLH3Q9UHC1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
MLH3Q9UHC1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
MLH3Q9UHC1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
MLH3Q9UHC1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
MLH3Q9UHC1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
MLH3Q9UHC1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
MLH3Q9UHC1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
MLH3Q9UHC1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
MLH3Q9UHC1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
MLH3Q9UHC1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
MLH3Q9UHC1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
MLH3Q9UHC1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
MLH3Q9UHC1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
MLH3Q9UHC1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
MLH3Q9UHC1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
MLH3Q9UHC1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
MLH3Q9UHC1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
MLH3Q9UHC1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
MLH3Q9UHC1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
MLH3Q9UHC1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
MLH3Q9UHC1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
MLH3Q9UHC1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
MLH3Q9UHC1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
MLH3Q9UHC1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
MLH3Q9UHC1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
MLH3Q9UHC1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
MLH3Q9UHC1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
MLH3Q9UHC1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
MLH3Q9UHC1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
MLH3Q9UHC1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
MLH3Q9UHC1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
MLH3Q9UHC1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms