Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
IFT172Q9UG01 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
IFT172Q9UG01 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
IFT172Q9UG01 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
IFT172Q9UG01 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
IFT172Q9UG01 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
IFT172Q9UG01 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
IFT172Q9UG01 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
IFT172Q9UG01 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
IFT172Q9UG01 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
IFT172Q9UG01 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
IFT172Q9UG01 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
IFT172Q9UG01 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
IFT172Q9UG01 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
IFT172Q9UG01 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
IFT172Q9UG01 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
IFT172Q9UG01 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
IFT172Q9UG01 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
IFT172Q9UG01 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
IFT172Q9UG01 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
IFT172Q9UG01 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
IFT172Q9UG01 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
IFT172Q9UG01 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
IFT172Q9UG01 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
IFT172Q9UG01 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
IFT172Q9UG01 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
IFT172Q9UG01 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
IFT172Q9UG01 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
IFT172Q9UG01 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
IFT172Q9UG01 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
IFT172Q9UG01 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
IFT172Q9UG01 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
IFT172Q9UG01 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
IFT172Q9UG01 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
IFT172Q9UG01 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
IFT172Q9UG01 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
IFT172Q9UG01 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
IFT172Q9UG01 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
IFT172Q9UG01 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
IFT172Q9UG01 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
IFT172Q9UG01 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
IFT172Q9UG01 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
IFT172Q9UG01 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
IFT172Q9UG01 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
IFT172Q9UG01 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
IFT172Q9UG01 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
IFT172Q9UG01 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
IFT172Q9UG01 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
IFT172Q9UG01 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
IFT172Q9UG01 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
IFT172Q9UG01 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
IFT172Q9UG01 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
IFT172Q9UG01 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
IFT172Q9UG01 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
IFT172Q9UG01 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
IFT172Q9UG01 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
IFT172Q9UG01 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
IFT172Q9UG01 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
IFT172Q9UG01 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
IFT172Q9UG01 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
IFT172Q9UG01 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
IFT172Q9UG01 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
IFT172Q9UG01 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
IFT172Q9UG01 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
IFT172Q9UG01 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
IFT172Q9UG01 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
IFT172Q9UG01 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
IFT172Q9UG01 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
IFT172Q9UG01 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
IFT172Q9UG01 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
IFT172Q9UG01 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
IFT172Q9UG01 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
IFT172Q9UG01 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
IFT172Q9UG01 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
IFT172Q9UG01 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
IFT172Q9UG01 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
IFT172Q9UG01 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
IFT172Q9UG01 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
IFT172Q9UG01 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
IFT172Q9UG01 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
IFT172Q9UG01 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
IFT172Q9UG01 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
IFT172Q9UG01 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
IFT172Q9UG01 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
IFT172Q9UG01 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
IFT172Q9UG01 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
IFT172Q9UG01 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
IFT172Q9UG01 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
IFT172Q9UG01 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
IFT172Q9UG01 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
IFT172Q9UG01 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
IFT172Q9UG01 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
IFT172Q9UG01 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
IFT172Q9UG01 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
IFT172Q9UG01 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
IFT172Q9UG01 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
IFT172Q9UG01 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
IFT172Q9UG01 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
IFT172Q9UG01 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
IFT172Q9UG01 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.7 ms