Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPG2Q9UBF2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.3 ms