Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TFIP11Q9UBB9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TFIP11Q9UBB9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TFIP11Q9UBB9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TFIP11Q9UBB9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TFIP11Q9UBB9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TFIP11Q9UBB9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TFIP11Q9UBB9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TFIP11Q9UBB9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TFIP11Q9UBB9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TFIP11Q9UBB9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TFIP11Q9UBB9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TFIP11Q9UBB9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TFIP11Q9UBB9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TFIP11Q9UBB9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TFIP11Q9UBB9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TFIP11Q9UBB9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TFIP11Q9UBB9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TFIP11Q9UBB9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TFIP11Q9UBB9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TFIP11Q9UBB9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TFIP11Q9UBB9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TFIP11Q9UBB9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TFIP11Q9UBB9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TFIP11Q9UBB9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TFIP11Q9UBB9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TFIP11Q9UBB9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TFIP11Q9UBB9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TFIP11Q9UBB9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TFIP11Q9UBB9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TFIP11Q9UBB9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TFIP11Q9UBB9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TFIP11Q9UBB9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TFIP11Q9UBB9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TFIP11Q9UBB9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TFIP11Q9UBB9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TFIP11Q9UBB9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TFIP11Q9UBB9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TFIP11Q9UBB9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TFIP11Q9UBB9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TFIP11Q9UBB9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TFIP11Q9UBB9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TFIP11Q9UBB9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TFIP11Q9UBB9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TFIP11Q9UBB9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TFIP11Q9UBB9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TFIP11Q9UBB9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TFIP11Q9UBB9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TFIP11Q9UBB9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TFIP11Q9UBB9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TFIP11Q9UBB9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TFIP11Q9UBB9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TFIP11Q9UBB9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TFIP11Q9UBB9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TFIP11Q9UBB9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TFIP11Q9UBB9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TFIP11Q9UBB9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TFIP11Q9UBB9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TFIP11Q9UBB9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TFIP11Q9UBB9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TFIP11Q9UBB9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TFIP11Q9UBB9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TFIP11Q9UBB9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TFIP11Q9UBB9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TFIP11Q9UBB9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TFIP11Q9UBB9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TFIP11Q9UBB9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TFIP11Q9UBB9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TFIP11Q9UBB9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TFIP11Q9UBB9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TFIP11Q9UBB9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TFIP11Q9UBB9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TFIP11Q9UBB9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TFIP11Q9UBB9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TFIP11Q9UBB9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms