Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL9Q9P2J3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL9Q9P2J3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL9Q9P2J3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL9Q9P2J3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL9Q9P2J3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL9Q9P2J3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL9Q9P2J3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL9Q9P2J3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL9Q9P2J3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL9Q9P2J3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL9Q9P2J3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL9Q9P2J3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL9Q9P2J3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL9Q9P2J3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL9Q9P2J3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL9Q9P2J3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL9Q9P2J3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL9Q9P2J3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL9Q9P2J3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL9Q9P2J3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL9Q9P2J3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL9Q9P2J3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL9Q9P2J3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL9Q9P2J3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL9Q9P2J3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL9Q9P2J3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL9Q9P2J3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL9Q9P2J3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL9Q9P2J3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL9Q9P2J3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL9Q9P2J3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL9Q9P2J3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL9Q9P2J3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL9Q9P2J3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL9Q9P2J3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL9Q9P2J3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL9Q9P2J3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL9Q9P2J3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms