Protein–RNA interactions for Protein: Q9P202

WHRN, Whirlin, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHRNQ9P202 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
WHRNQ9P202 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
WHRNQ9P202 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
WHRNQ9P202 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
WHRNQ9P202 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
WHRNQ9P202 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
WHRNQ9P202 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
WHRNQ9P202 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
WHRNQ9P202 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WHRNQ9P202 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
WHRNQ9P202 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
WHRNQ9P202 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
WHRNQ9P202 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
WHRNQ9P202 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WHRNQ9P202 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
WHRNQ9P202 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WHRNQ9P202 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WHRNQ9P202 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WHRNQ9P202 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WHRNQ9P202 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
WHRNQ9P202 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
WHRNQ9P202 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
WHRNQ9P202 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WHRNQ9P202 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
WHRNQ9P202 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
WHRNQ9P202 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
WHRNQ9P202 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WHRNQ9P202 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WHRNQ9P202 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WHRNQ9P202 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
WHRNQ9P202 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WHRNQ9P202 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
WHRNQ9P202 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WHRNQ9P202 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WHRNQ9P202 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WHRNQ9P202 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WHRNQ9P202 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
WHRNQ9P202 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
WHRNQ9P202 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
WHRNQ9P202 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
WHRNQ9P202 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
WHRNQ9P202 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
WHRNQ9P202 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
WHRNQ9P202 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
WHRNQ9P202 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
WHRNQ9P202 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
WHRNQ9P202 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
WHRNQ9P202 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WHRNQ9P202 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
WHRNQ9P202 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
WHRNQ9P202 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms