Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZJ4

SACS, Sacsin, humanhuman

Predictions only

Length 4,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SACSQ9NZJ4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SACSQ9NZJ4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms