Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CACNA2D2Q9NY47 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA2D2Q9NY47 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA2D2Q9NY47 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA2D2Q9NY47 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA2D2Q9NY47 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA2D2Q9NY47 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA2D2Q9NY47 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA2D2Q9NY47 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA2D2Q9NY47 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA2D2Q9NY47 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA2D2Q9NY47 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA2D2Q9NY47 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA2D2Q9NY47 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA2D2Q9NY47 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA2D2Q9NY47 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA2D2Q9NY47 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA2D2Q9NY47 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA2D2Q9NY47 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA2D2Q9NY47 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA2D2Q9NY47 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA2D2Q9NY47 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA2D2Q9NY47 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA2D2Q9NY47 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA2D2Q9NY47 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA2D2Q9NY47 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA2D2Q9NY47 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA2D2Q9NY47 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA2D2Q9NY47 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA2D2Q9NY47 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA2D2Q9NY47 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA2D2Q9NY47 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA2D2Q9NY47 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA2D2Q9NY47 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA2D2Q9NY47 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA2D2Q9NY47 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA2D2Q9NY47 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA2D2Q9NY47 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA2D2Q9NY47 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA2D2Q9NY47 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA2D2Q9NY47 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA2D2Q9NY47 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA2D2Q9NY47 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA2D2Q9NY47 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA2D2Q9NY47 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA2D2Q9NY47 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA2D2Q9NY47 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms