Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR33

POLE4, DNA polymerase epsilon subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE4Q9NR33 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLE4Q9NR33 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLE4Q9NR33 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLE4Q9NR33 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLE4Q9NR33 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLE4Q9NR33 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLE4Q9NR33 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLE4Q9NR33 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLE4Q9NR33 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLE4Q9NR33 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLE4Q9NR33 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLE4Q9NR33 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLE4Q9NR33 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLE4Q9NR33 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLE4Q9NR33 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLE4Q9NR33 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLE4Q9NR33 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLE4Q9NR33 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLE4Q9NR33 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLE4Q9NR33 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLE4Q9NR33 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POLE4Q9NR33 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POLE4Q9NR33 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLE4Q9NR33 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLE4Q9NR33 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLE4Q9NR33 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLE4Q9NR33 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLE4Q9NR33 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLE4Q9NR33 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLE4Q9NR33 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLE4Q9NR33 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLE4Q9NR33 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms