Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS4Q9NQG7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS4Q9NQG7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS4Q9NQG7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS4Q9NQG7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS4Q9NQG7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS4Q9NQG7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HPS4Q9NQG7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HPS4Q9NQG7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HPS4Q9NQG7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HPS4Q9NQG7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HPS4Q9NQG7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HPS4Q9NQG7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HPS4Q9NQG7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPS4Q9NQG7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPS4Q9NQG7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPS4Q9NQG7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPS4Q9NQG7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPS4Q9NQG7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPS4Q9NQG7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPS4Q9NQG7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPS4Q9NQG7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPS4Q9NQG7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HPS4Q9NQG7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HPS4Q9NQG7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HPS4Q9NQG7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS4Q9NQG7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS4Q9NQG7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS4Q9NQG7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS4Q9NQG7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS4Q9NQG7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS4Q9NQG7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS4Q9NQG7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS4Q9NQG7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS4Q9NQG7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HPS4Q9NQG7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HPS4Q9NQG7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HPS4Q9NQG7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms