Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN3

TMEM8A, Post-GPI attachment to proteins factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM8AQ9HCN3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM8AQ9HCN3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM8AQ9HCN3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMEM8AQ9HCN3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM8AQ9HCN3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM8AQ9HCN3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM8AQ9HCN3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM8AQ9HCN3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM8AQ9HCN3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM8AQ9HCN3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM8AQ9HCN3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM8AQ9HCN3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM8AQ9HCN3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM8AQ9HCN3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM8AQ9HCN3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM8AQ9HCN3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM8AQ9HCN3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM8AQ9HCN3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM8AQ9HCN3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM8AQ9HCN3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM8AQ9HCN3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM8AQ9HCN3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM8AQ9HCN3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM8AQ9HCN3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM8AQ9HCN3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM8AQ9HCN3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM8AQ9HCN3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM8AQ9HCN3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM8AQ9HCN3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM8AQ9HCN3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM8AQ9HCN3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM8AQ9HCN3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM8AQ9HCN3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM8AQ9HCN3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM8AQ9HCN3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM8AQ9HCN3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM8AQ9HCN3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM8AQ9HCN3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM8AQ9HCN3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM8AQ9HCN3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM8AQ9HCN3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM8AQ9HCN3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM8AQ9HCN3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM8AQ9HCN3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM8AQ9HCN3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM8AQ9HCN3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM8AQ9HCN3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM8AQ9HCN3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM8AQ9HCN3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM8AQ9HCN3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM8AQ9HCN3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms