Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TNRC6CQ9HCJ0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TNRC6CQ9HCJ0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TNRC6CQ9HCJ0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNRC6CQ9HCJ0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNRC6CQ9HCJ0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNRC6CQ9HCJ0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNRC6CQ9HCJ0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNRC6CQ9HCJ0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNRC6CQ9HCJ0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TNRC6CQ9HCJ0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TNRC6CQ9HCJ0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNRC6CQ9HCJ0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNRC6CQ9HCJ0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNRC6CQ9HCJ0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNRC6CQ9HCJ0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TNRC6CQ9HCJ0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNRC6CQ9HCJ0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNRC6CQ9HCJ0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TNRC6CQ9HCJ0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNRC6CQ9HCJ0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNRC6CQ9HCJ0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNRC6CQ9HCJ0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNRC6CQ9HCJ0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNRC6CQ9HCJ0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNRC6CQ9HCJ0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNRC6CQ9HCJ0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.24
TNRC6CQ9HCJ0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNRC6CQ9HCJ0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TNRC6CQ9HCJ0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNRC6CQ9HCJ0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNRC6CQ9HCJ0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNRC6CQ9HCJ0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNRC6CQ9HCJ0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNRC6CQ9HCJ0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNRC6CQ9HCJ0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNRC6CQ9HCJ0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNRC6CQ9HCJ0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNRC6CQ9HCJ0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNRC6CQ9HCJ0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNRC6CQ9HCJ0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNRC6CQ9HCJ0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNRC6CQ9HCJ0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNRC6CQ9HCJ0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNRC6CQ9HCJ0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNRC6CQ9HCJ0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNRC6CQ9HCJ0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNRC6CQ9HCJ0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNRC6CQ9HCJ0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNRC6CQ9HCJ0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TNRC6CQ9HCJ0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNRC6CQ9HCJ0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNRC6CQ9HCJ0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNRC6CQ9HCJ0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNRC6CQ9HCJ0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNRC6CQ9HCJ0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNRC6CQ9HCJ0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNRC6CQ9HCJ0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TNRC6CQ9HCJ0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TNRC6CQ9HCJ0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNRC6CQ9HCJ0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNRC6CQ9HCJ0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNRC6CQ9HCJ0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNRC6CQ9HCJ0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNRC6CQ9HCJ0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TNRC6CQ9HCJ0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TNRC6CQ9HCJ0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TNRC6CQ9HCJ0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TNRC6CQ9HCJ0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TNRC6CQ9HCJ0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TNRC6CQ9HCJ0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TNRC6CQ9HCJ0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TNRC6CQ9HCJ0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TNRC6CQ9HCJ0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TNRC6CQ9HCJ0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNRC6CQ9HCJ0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNRC6CQ9HCJ0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TNRC6CQ9HCJ0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNRC6CQ9HCJ0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNRC6CQ9HCJ0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNRC6CQ9HCJ0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNRC6CQ9HCJ0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNRC6CQ9HCJ0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TNRC6CQ9HCJ0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNRC6CQ9HCJ0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNRC6CQ9HCJ0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TNRC6CQ9HCJ0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNRC6CQ9HCJ0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNRC6CQ9HCJ0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNRC6CQ9HCJ0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNRC6CQ9HCJ0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TNRC6CQ9HCJ0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNRC6CQ9HCJ0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNRC6CQ9HCJ0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TNRC6CQ9HCJ0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TNRC6CQ9HCJ0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TNRC6CQ9HCJ0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms