Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T2

SEMA6C, Semaphorin-6C, humanhuman

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6CQ9H3T2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA6CQ9H3T2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA6CQ9H3T2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA6CQ9H3T2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA6CQ9H3T2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA6CQ9H3T2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA6CQ9H3T2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA6CQ9H3T2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA6CQ9H3T2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA6CQ9H3T2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA6CQ9H3T2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA6CQ9H3T2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA6CQ9H3T2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA6CQ9H3T2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA6CQ9H3T2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA6CQ9H3T2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA6CQ9H3T2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA6CQ9H3T2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA6CQ9H3T2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA6CQ9H3T2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA6CQ9H3T2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA6CQ9H3T2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA6CQ9H3T2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA6CQ9H3T2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA6CQ9H3T2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA6CQ9H3T2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA6CQ9H3T2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA6CQ9H3T2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA6CQ9H3T2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA6CQ9H3T2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA6CQ9H3T2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA6CQ9H3T2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA6CQ9H3T2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA6CQ9H3T2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA6CQ9H3T2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA6CQ9H3T2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA6CQ9H3T2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA6CQ9H3T2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA6CQ9H3T2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA6CQ9H3T2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA6CQ9H3T2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA6CQ9H3T2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA6CQ9H3T2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA6CQ9H3T2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA6CQ9H3T2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA6CQ9H3T2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA6CQ9H3T2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA6CQ9H3T2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA6CQ9H3T2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA6CQ9H3T2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA6CQ9H3T2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA6CQ9H3T2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA6CQ9H3T2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA6CQ9H3T2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA6CQ9H3T2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA6CQ9H3T2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA6CQ9H3T2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA6CQ9H3T2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA6CQ9H3T2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA6CQ9H3T2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA6CQ9H3T2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA6CQ9H3T2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA6CQ9H3T2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA6CQ9H3T2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA6CQ9H3T2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA6CQ9H3T2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA6CQ9H3T2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA6CQ9H3T2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA6CQ9H3T2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA6CQ9H3T2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA6CQ9H3T2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA6CQ9H3T2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA6CQ9H3T2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA6CQ9H3T2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA6CQ9H3T2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA6CQ9H3T2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA6CQ9H3T2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA6CQ9H3T2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA6CQ9H3T2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA6CQ9H3T2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA6CQ9H3T2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA6CQ9H3T2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA6CQ9H3T2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA6CQ9H3T2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA6CQ9H3T2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA6CQ9H3T2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA6CQ9H3T2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA6CQ9H3T2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA6CQ9H3T2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA6CQ9H3T2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA6CQ9H3T2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA6CQ9H3T2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA6CQ9H3T2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA6CQ9H3T2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA6CQ9H3T2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA6CQ9H3T2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMA6CQ9H3T2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms