Protein–RNA interactions for Protein: Q9H173

SIL1, Nucleotide exchange factor SIL1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIL1Q9H173 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIL1Q9H173 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIL1Q9H173 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIL1Q9H173 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIL1Q9H173 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIL1Q9H173 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIL1Q9H173 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIL1Q9H173 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIL1Q9H173 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIL1Q9H173 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIL1Q9H173 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIL1Q9H173 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIL1Q9H173 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
SIL1Q9H173 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIL1Q9H173 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIL1Q9H173 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIL1Q9H173 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIL1Q9H173 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIL1Q9H173 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIL1Q9H173 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIL1Q9H173 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIL1Q9H173 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIL1Q9H173 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIL1Q9H173 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIL1Q9H173 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIL1Q9H173 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIL1Q9H173 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIL1Q9H173 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIL1Q9H173 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIL1Q9H173 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIL1Q9H173 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIL1Q9H173 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIL1Q9H173 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIL1Q9H173 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIL1Q9H173 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SIL1Q9H173 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIL1Q9H173 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIL1Q9H173 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIL1Q9H173 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIL1Q9H173 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIL1Q9H173 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIL1Q9H173 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIL1Q9H173 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIL1Q9H173 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIL1Q9H173 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIL1Q9H173 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIL1Q9H173 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIL1Q9H173 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIL1Q9H173 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIL1Q9H173 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SIL1Q9H173 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms