Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR6

RTN4R, Reticulon-4 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4RQ9BZR6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RTN4RQ9BZR6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RTN4RQ9BZR6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RTN4RQ9BZR6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RTN4RQ9BZR6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RTN4RQ9BZR6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RTN4RQ9BZR6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RTN4RQ9BZR6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RTN4RQ9BZR6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RTN4RQ9BZR6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RTN4RQ9BZR6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RTN4RQ9BZR6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RTN4RQ9BZR6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RTN4RQ9BZR6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RTN4RQ9BZR6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RTN4RQ9BZR6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RTN4RQ9BZR6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTN4RQ9BZR6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTN4RQ9BZR6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTN4RQ9BZR6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTN4RQ9BZR6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTN4RQ9BZR6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTN4RQ9BZR6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTN4RQ9BZR6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTN4RQ9BZR6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTN4RQ9BZR6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTN4RQ9BZR6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTN4RQ9BZR6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTN4RQ9BZR6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTN4RQ9BZR6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTN4RQ9BZR6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RTN4RQ9BZR6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RTN4RQ9BZR6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RTN4RQ9BZR6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RTN4RQ9BZR6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms