Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RUFY1Q96T51 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUFY1Q96T51 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUFY1Q96T51 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RUFY1Q96T51 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUFY1Q96T51 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RUFY1Q96T51 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RUFY1Q96T51 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUFY1Q96T51 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUFY1Q96T51 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUFY1Q96T51 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUFY1Q96T51 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUFY1Q96T51 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUFY1Q96T51 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUFY1Q96T51 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUFY1Q96T51 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUFY1Q96T51 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUFY1Q96T51 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUFY1Q96T51 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY1Q96T51 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY1Q96T51 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY1Q96T51 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY1Q96T51 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY1Q96T51 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY1Q96T51 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY1Q96T51 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY1Q96T51 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY1Q96T51 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUFY1Q96T51 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUFY1Q96T51 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUFY1Q96T51 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUFY1Q96T51 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms