Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRRC1Q96M27 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms