Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2E2Q96LR5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2E2Q96LR5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2E2Q96LR5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2E2Q96LR5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2E2Q96LR5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2E2Q96LR5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2E2Q96LR5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2E2Q96LR5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2E2Q96LR5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2E2Q96LR5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2E2Q96LR5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2E2Q96LR5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2E2Q96LR5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2E2Q96LR5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2E2Q96LR5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2E2Q96LR5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2E2Q96LR5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2E2Q96LR5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2E2Q96LR5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2E2Q96LR5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2E2Q96LR5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2E2Q96LR5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2E2Q96LR5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2E2Q96LR5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2E2Q96LR5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2E2Q96LR5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2E2Q96LR5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2E2Q96LR5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2E2Q96LR5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2E2Q96LR5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2E2Q96LR5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2E2Q96LR5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2E2Q96LR5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2E2Q96LR5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2E2Q96LR5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2E2Q96LR5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2E2Q96LR5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2E2Q96LR5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2E2Q96LR5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2E2Q96LR5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2E2Q96LR5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2E2Q96LR5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2E2Q96LR5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2E2Q96LR5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2E2Q96LR5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE2E2Q96LR5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms