Protein–RNA interactions for Protein: Q96JE7

SEC16B, Protein transport protein Sec16B, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16BQ96JE7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEC16BQ96JE7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms