Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCTD12Q96CX2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCTD12Q96CX2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCTD12Q96CX2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCTD12Q96CX2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KCTD12Q96CX2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCTD12Q96CX2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCTD12Q96CX2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCTD12Q96CX2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCTD12Q96CX2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCTD12Q96CX2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCTD12Q96CX2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCTD12Q96CX2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCTD12Q96CX2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCTD12Q96CX2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCTD12Q96CX2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KCTD12Q96CX2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCTD12Q96CX2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCTD12Q96CX2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCTD12Q96CX2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCTD12Q96CX2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCTD12Q96CX2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCTD12Q96CX2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCTD12Q96CX2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KCTD12Q96CX2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCTD12Q96CX2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCTD12Q96CX2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCTD12Q96CX2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCTD12Q96CX2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCTD12Q96CX2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KCTD12Q96CX2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCTD12Q96CX2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCTD12Q96CX2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KCTD12Q96CX2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCTD12Q96CX2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCTD12Q96CX2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCTD12Q96CX2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KCTD12Q96CX2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KCTD12Q96CX2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KCTD12Q96CX2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 209.4 ms