Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RFT1Q96AA3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms