Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CSRNP3Q8WYN3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CSRNP3Q8WYN3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
CSRNP3Q8WYN3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
CSRNP3Q8WYN3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.72
CSRNP3Q8WYN3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
CSRNP3Q8WYN3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
CSRNP3Q8WYN3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
CSRNP3Q8WYN3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CSRNP3Q8WYN3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CSRNP3Q8WYN3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CSRNP3Q8WYN3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CSRNP3Q8WYN3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
CSRNP3Q8WYN3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
CSRNP3Q8WYN3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
CSRNP3Q8WYN3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CSRNP3Q8WYN3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CSRNP3Q8WYN3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CSRNP3Q8WYN3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CSRNP3Q8WYN3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CSRNP3Q8WYN3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CSRNP3Q8WYN3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CSRNP3Q8WYN3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CSRNP3Q8WYN3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
CSRNP3Q8WYN3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CSRNP3Q8WYN3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CSRNP3Q8WYN3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CSRNP3Q8WYN3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CSRNP3Q8WYN3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CSRNP3Q8WYN3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CSRNP3Q8WYN3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CSRNP3Q8WYN3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CSRNP3Q8WYN3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CSRNP3Q8WYN3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CSRNP3Q8WYN3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.72
CSRNP3Q8WYN3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
CSRNP3Q8WYN3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
CSRNP3Q8WYN3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
CSRNP3Q8WYN3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
CSRNP3Q8WYN3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
CSRNP3Q8WYN3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC38.25■■■■□ 3.71
CSRNP3Q8WYN3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
CSRNP3Q8WYN3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
CSRNP3Q8WYN3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
CSRNP3Q8WYN3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
CSRNP3Q8WYN3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CSRNP3Q8WYN3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CSRNP3Q8WYN3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CSRNP3Q8WYN3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CSRNP3Q8WYN3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
CSRNP3Q8WYN3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
CSRNP3Q8WYN3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
CSRNP3Q8WYN3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
CSRNP3Q8WYN3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
CSRNP3Q8WYN3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
CSRNP3Q8WYN3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
CSRNP3Q8WYN3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
CSRNP3Q8WYN3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
CSRNP3Q8WYN3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
CSRNP3Q8WYN3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
CSRNP3Q8WYN3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
CSRNP3Q8WYN3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
CSRNP3Q8WYN3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CSRNP3Q8WYN3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CSRNP3Q8WYN3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CSRNP3Q8WYN3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CSRNP3Q8WYN3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CSRNP3Q8WYN3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
CSRNP3Q8WYN3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CSRNP3Q8WYN3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CSRNP3Q8WYN3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
CSRNP3Q8WYN3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
CSRNP3Q8WYN3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC38.18■■■■□ 3.7
CSRNP3Q8WYN3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
CSRNP3Q8WYN3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
CSRNP3Q8WYN3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
CSRNP3Q8WYN3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
CSRNP3Q8WYN3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CSRNP3Q8WYN3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
CSRNP3Q8WYN3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CSRNP3Q8WYN3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CSRNP3Q8WYN3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CSRNP3Q8WYN3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
CSRNP3Q8WYN3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CSRNP3Q8WYN3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CSRNP3Q8WYN3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
CSRNP3Q8WYN3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CSRNP3Q8WYN3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CSRNP3Q8WYN3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CSRNP3Q8WYN3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CSRNP3Q8WYN3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CSRNP3Q8WYN3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
CSRNP3Q8WYN3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CSRNP3Q8WYN3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC38.14■■■■□ 3.7
CSRNP3Q8WYN3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CSRNP3Q8WYN3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CSRNP3Q8WYN3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
CSRNP3Q8WYN3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
CSRNP3Q8WYN3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
CSRNP3Q8WYN3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms