Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF30

WHAMM, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMQ8TF30 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
WHAMMQ8TF30 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
WHAMMQ8TF30 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
WHAMMQ8TF30 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
WHAMMQ8TF30 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
WHAMMQ8TF30 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
WHAMMQ8TF30 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
WHAMMQ8TF30 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
WHAMMQ8TF30 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
WHAMMQ8TF30 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
WHAMMQ8TF30 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
WHAMMQ8TF30 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
WHAMMQ8TF30 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
WHAMMQ8TF30 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
WHAMMQ8TF30 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25■■□□□ 1.59
WHAMMQ8TF30 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25■■□□□ 1.59
WHAMMQ8TF30 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
WHAMMQ8TF30 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
WHAMMQ8TF30 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
WHAMMQ8TF30 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
WHAMMQ8TF30 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
WHAMMQ8TF30 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
WHAMMQ8TF30 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
WHAMMQ8TF30 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
WHAMMQ8TF30 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
WHAMMQ8TF30 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
WHAMMQ8TF30 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
WHAMMQ8TF30 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
WHAMMQ8TF30 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
WHAMMQ8TF30 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
WHAMMQ8TF30 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
WHAMMQ8TF30 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
WHAMMQ8TF30 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
WHAMMQ8TF30 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
WHAMMQ8TF30 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
WHAMMQ8TF30 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
WHAMMQ8TF30 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
WHAMMQ8TF30 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
WHAMMQ8TF30 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WHAMMQ8TF30 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WHAMMQ8TF30 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WHAMMQ8TF30 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WHAMMQ8TF30 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WHAMMQ8TF30 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
WHAMMQ8TF30 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
WHAMMQ8TF30 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
WHAMMQ8TF30 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
WHAMMQ8TF30 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
WHAMMQ8TF30 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
WHAMMQ8TF30 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
WHAMMQ8TF30 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
WHAMMQ8TF30 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
WHAMMQ8TF30 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
WHAMMQ8TF30 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms