Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DTX3LQ8TDB6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms