Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBN0

RAB3IL1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IL1Q8TBN0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB3IL1Q8TBN0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB3IL1Q8TBN0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB3IL1Q8TBN0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB3IL1Q8TBN0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB3IL1Q8TBN0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB3IL1Q8TBN0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB3IL1Q8TBN0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB3IL1Q8TBN0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RAB3IL1Q8TBN0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB3IL1Q8TBN0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB3IL1Q8TBN0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB3IL1Q8TBN0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB3IL1Q8TBN0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB3IL1Q8TBN0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB3IL1Q8TBN0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB3IL1Q8TBN0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB3IL1Q8TBN0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB3IL1Q8TBN0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB3IL1Q8TBN0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB3IL1Q8TBN0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB3IL1Q8TBN0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB3IL1Q8TBN0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB3IL1Q8TBN0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB3IL1Q8TBN0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB3IL1Q8TBN0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB3IL1Q8TBN0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3IL1Q8TBN0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3IL1Q8TBN0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3IL1Q8TBN0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3IL1Q8TBN0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3IL1Q8TBN0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3IL1Q8TBN0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3IL1Q8TBN0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3IL1Q8TBN0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3IL1Q8TBN0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3IL1Q8TBN0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3IL1Q8TBN0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3IL1Q8TBN0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3IL1Q8TBN0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3IL1Q8TBN0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3IL1Q8TBN0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3IL1Q8TBN0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
RAB3IL1Q8TBN0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RAB3IL1Q8TBN0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms