Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAF3

WDR48, WD repeat-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR48Q8TAF3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR48Q8TAF3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR48Q8TAF3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR48Q8TAF3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR48Q8TAF3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR48Q8TAF3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR48Q8TAF3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR48Q8TAF3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR48Q8TAF3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR48Q8TAF3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR48Q8TAF3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR48Q8TAF3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR48Q8TAF3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR48Q8TAF3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR48Q8TAF3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR48Q8TAF3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR48Q8TAF3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR48Q8TAF3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR48Q8TAF3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR48Q8TAF3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR48Q8TAF3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR48Q8TAF3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR48Q8TAF3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR48Q8TAF3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR48Q8TAF3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR48Q8TAF3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR48Q8TAF3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR48Q8TAF3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR48Q8TAF3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR48Q8TAF3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
WDR48Q8TAF3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR48Q8TAF3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR48Q8TAF3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms