Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBW4

SLC38A9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A9Q8NBW4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC38A9Q8NBW4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms