Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9F8

ZNF454, Zinc finger protein 454, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF454Q8N9F8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF454Q8N9F8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF454Q8N9F8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF454Q8N9F8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF454Q8N9F8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF454Q8N9F8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF454Q8N9F8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF454Q8N9F8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF454Q8N9F8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF454Q8N9F8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF454Q8N9F8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF454Q8N9F8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF454Q8N9F8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF454Q8N9F8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF454Q8N9F8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF454Q8N9F8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF454Q8N9F8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF454Q8N9F8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF454Q8N9F8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF454Q8N9F8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF454Q8N9F8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF454Q8N9F8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms