Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYNE4Q8N205 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYNE4Q8N205 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYNE4Q8N205 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYNE4Q8N205 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SYNE4Q8N205 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SYNE4Q8N205 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYNE4Q8N205 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYNE4Q8N205 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SYNE4Q8N205 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SYNE4Q8N205 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYNE4Q8N205 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SYNE4Q8N205 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYNE4Q8N205 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYNE4Q8N205 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYNE4Q8N205 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNE4Q8N205 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNE4Q8N205 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNE4Q8N205 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNE4Q8N205 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNE4Q8N205 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNE4Q8N205 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNE4Q8N205 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNE4Q8N205 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNE4Q8N205 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNE4Q8N205 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNE4Q8N205 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNE4Q8N205 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNE4Q8N205 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYNE4Q8N205 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYNE4Q8N205 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYNE4Q8N205 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYNE4Q8N205 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SYNE4Q8N205 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNE4Q8N205 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNE4Q8N205 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNE4Q8N205 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNE4Q8N205 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNE4Q8N205 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNE4Q8N205 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNE4Q8N205 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNE4Q8N205 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNE4Q8N205 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNE4Q8N205 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNE4Q8N205 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYNE4Q8N205 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SYNE4Q8N205 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYNE4Q8N205 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYNE4Q8N205 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 520.8 ms