Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC83Q8IWF9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC83Q8IWF9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC83Q8IWF9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC83Q8IWF9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC83Q8IWF9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC83Q8IWF9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC83Q8IWF9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC83Q8IWF9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC83Q8IWF9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC83Q8IWF9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC83Q8IWF9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC83Q8IWF9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC83Q8IWF9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC83Q8IWF9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC83Q8IWF9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC83Q8IWF9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC83Q8IWF9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC83Q8IWF9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC83Q8IWF9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC83Q8IWF9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC83Q8IWF9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC83Q8IWF9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC83Q8IWF9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC83Q8IWF9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC83Q8IWF9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC83Q8IWF9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC83Q8IWF9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC83Q8IWF9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC83Q8IWF9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC83Q8IWF9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC83Q8IWF9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC83Q8IWF9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC83Q8IWF9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC83Q8IWF9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC83Q8IWF9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC83Q8IWF9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC83Q8IWF9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC83Q8IWF9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC83Q8IWF9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC83Q8IWF9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC83Q8IWF9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC83Q8IWF9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms