Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDXQ7Z353 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDXQ7Z353 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDXQ7Z353 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDXQ7Z353 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HDXQ7Z353 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDXQ7Z353 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDXQ7Z353 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDXQ7Z353 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDXQ7Z353 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDXQ7Z353 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDXQ7Z353 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDXQ7Z353 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDXQ7Z353 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDXQ7Z353 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDXQ7Z353 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDXQ7Z353 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDXQ7Z353 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDXQ7Z353 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HDXQ7Z353 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDXQ7Z353 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDXQ7Z353 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDXQ7Z353 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDXQ7Z353 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDXQ7Z353 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDXQ7Z353 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDXQ7Z353 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HDXQ7Z353 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDXQ7Z353 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HDXQ7Z353 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDXQ7Z353 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDXQ7Z353 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDXQ7Z353 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDXQ7Z353 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDXQ7Z353 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDXQ7Z353 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDXQ7Z353 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDXQ7Z353 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDXQ7Z353 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDXQ7Z353 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDXQ7Z353 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDXQ7Z353 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDXQ7Z353 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDXQ7Z353 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDXQ7Z353 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDXQ7Z353 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDXQ7Z353 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDXQ7Z353 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDXQ7Z353 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDXQ7Z353 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDXQ7Z353 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDXQ7Z353 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDXQ7Z353 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDXQ7Z353 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDXQ7Z353 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDXQ7Z353 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HDXQ7Z353 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDXQ7Z353 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDXQ7Z353 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDXQ7Z353 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDXQ7Z353 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDXQ7Z353 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HDXQ7Z353 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDXQ7Z353 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDXQ7Z353 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDXQ7Z353 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDXQ7Z353 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDXQ7Z353 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HDXQ7Z353 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDXQ7Z353 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDXQ7Z353 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDXQ7Z353 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDXQ7Z353 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDXQ7Z353 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDXQ7Z353 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDXQ7Z353 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDXQ7Z353 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDXQ7Z353 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDXQ7Z353 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDXQ7Z353 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDXQ7Z353 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HDXQ7Z353 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDXQ7Z353 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDXQ7Z353 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HDXQ7Z353 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDXQ7Z353 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDXQ7Z353 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDXQ7Z353 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDXQ7Z353 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDXQ7Z353 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDXQ7Z353 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDXQ7Z353 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDXQ7Z353 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDXQ7Z353 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDXQ7Z353 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HDXQ7Z353 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDXQ7Z353 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDXQ7Z353 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDXQ7Z353 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDXQ7Z353 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms