Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BHLHA9Q7RTU4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms