Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
WDR88Q6ZMY6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms