Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EFCAB12Q6NXP0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EFCAB12Q6NXP0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EFCAB12Q6NXP0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EFCAB12Q6NXP0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EFCAB12Q6NXP0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
EFCAB12Q6NXP0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EFCAB12Q6NXP0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms