Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
APOBEC3HQ6NTF7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
APOBEC3HQ6NTF7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
APOBEC3HQ6NTF7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
APOBEC3HQ6NTF7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
APOBEC3HQ6NTF7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
APOBEC3HQ6NTF7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
APOBEC3HQ6NTF7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
APOBEC3HQ6NTF7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
APOBEC3HQ6NTF7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
APOBEC3HQ6NTF7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
APOBEC3HQ6NTF7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
APOBEC3HQ6NTF7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
APOBEC3HQ6NTF7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
APOBEC3HQ6NTF7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
APOBEC3HQ6NTF7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
APOBEC3HQ6NTF7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
APOBEC3HQ6NTF7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
APOBEC3HQ6NTF7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
APOBEC3HQ6NTF7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
APOBEC3HQ6NTF7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
APOBEC3HQ6NTF7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
APOBEC3HQ6NTF7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
APOBEC3HQ6NTF7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
APOBEC3HQ6NTF7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
APOBEC3HQ6NTF7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
APOBEC3HQ6NTF7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
APOBEC3HQ6NTF7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
APOBEC3HQ6NTF7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
APOBEC3HQ6NTF7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
APOBEC3HQ6NTF7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
APOBEC3HQ6NTF7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
APOBEC3HQ6NTF7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
APOBEC3HQ6NTF7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
APOBEC3HQ6NTF7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
APOBEC3HQ6NTF7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
APOBEC3HQ6NTF7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
APOBEC3HQ6NTF7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
APOBEC3HQ6NTF7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
APOBEC3HQ6NTF7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
APOBEC3HQ6NTF7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
APOBEC3HQ6NTF7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
APOBEC3HQ6NTF7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
APOBEC3HQ6NTF7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
APOBEC3HQ6NTF7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
APOBEC3HQ6NTF7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
APOBEC3HQ6NTF7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
APOBEC3HQ6NTF7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
APOBEC3HQ6NTF7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
APOBEC3HQ6NTF7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
APOBEC3HQ6NTF7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
APOBEC3HQ6NTF7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
APOBEC3HQ6NTF7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APOBEC3HQ6NTF7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APOBEC3HQ6NTF7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APOBEC3HQ6NTF7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
APOBEC3HQ6NTF7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
APOBEC3HQ6NTF7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
APOBEC3HQ6NTF7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
APOBEC3HQ6NTF7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
APOBEC3HQ6NTF7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APOBEC3HQ6NTF7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
APOBEC3HQ6NTF7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
APOBEC3HQ6NTF7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
APOBEC3HQ6NTF7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
APOBEC3HQ6NTF7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
APOBEC3HQ6NTF7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
APOBEC3HQ6NTF7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
APOBEC3HQ6NTF7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
APOBEC3HQ6NTF7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
APOBEC3HQ6NTF7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
APOBEC3HQ6NTF7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
APOBEC3HQ6NTF7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
APOBEC3HQ6NTF7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
APOBEC3HQ6NTF7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
APOBEC3HQ6NTF7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
APOBEC3HQ6NTF7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
APOBEC3HQ6NTF7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
APOBEC3HQ6NTF7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
APOBEC3HQ6NTF7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
APOBEC3HQ6NTF7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
APOBEC3HQ6NTF7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
APOBEC3HQ6NTF7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
APOBEC3HQ6NTF7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
APOBEC3HQ6NTF7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
APOBEC3HQ6NTF7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
APOBEC3HQ6NTF7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
APOBEC3HQ6NTF7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
APOBEC3HQ6NTF7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
APOBEC3HQ6NTF7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
APOBEC3HQ6NTF7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
APOBEC3HQ6NTF7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
APOBEC3HQ6NTF7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
APOBEC3HQ6NTF7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms