Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTQ0

TTC39B, Tetratricopeptide repeat protein 39B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39BQ5VTQ0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms