Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SAMD5Q5TGI4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD5Q5TGI4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD5Q5TGI4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD5Q5TGI4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD5Q5TGI4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD5Q5TGI4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD5Q5TGI4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD5Q5TGI4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD5Q5TGI4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD5Q5TGI4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD5Q5TGI4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD5Q5TGI4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD5Q5TGI4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms