Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RPL39P5Q59GN2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms