Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRFIP1Q32MZ4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRFIP1Q32MZ4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRFIP1Q32MZ4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRFIP1Q32MZ4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRFIP1Q32MZ4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRFIP1Q32MZ4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRFIP1Q32MZ4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRFIP1Q32MZ4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRFIP1Q32MZ4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRFIP1Q32MZ4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRFIP1Q32MZ4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRFIP1Q32MZ4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRFIP1Q32MZ4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRFIP1Q32MZ4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRFIP1Q32MZ4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRFIP1Q32MZ4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRFIP1Q32MZ4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRFIP1Q32MZ4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRFIP1Q32MZ4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRFIP1Q32MZ4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRFIP1Q32MZ4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRFIP1Q32MZ4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRFIP1Q32MZ4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LRRFIP1Q32MZ4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRFIP1Q32MZ4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRFIP1Q32MZ4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRFIP1Q32MZ4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRFIP1Q32MZ4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRFIP1Q32MZ4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRFIP1Q32MZ4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRFIP1Q32MZ4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRFIP1Q32MZ4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRFIP1Q32MZ4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRFIP1Q32MZ4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRFIP1Q32MZ4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRFIP1Q32MZ4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRFIP1Q32MZ4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRFIP1Q32MZ4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRFIP1Q32MZ4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRFIP1Q32MZ4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRFIP1Q32MZ4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRFIP1Q32MZ4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRFIP1Q32MZ4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRFIP1Q32MZ4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRFIP1Q32MZ4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRFIP1Q32MZ4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRFIP1Q32MZ4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRFIP1Q32MZ4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRFIP1Q32MZ4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRFIP1Q32MZ4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms