Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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PDE6HQ13956 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE6HQ13956 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE6HQ13956 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE6HQ13956 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
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PDE6HQ13956 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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PDE6HQ13956 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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PDE6HQ13956 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE6HQ13956 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE6HQ13956 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE6HQ13956 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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PDE6HQ13956 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE6HQ13956 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE6HQ13956 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE6HQ13956 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE6HQ13956 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE6HQ13956 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE6HQ13956 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE6HQ13956 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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