Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CUL4AQ13619 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CUL4AQ13619 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CUL4AQ13619 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CUL4AQ13619 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CUL4AQ13619 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CUL4AQ13619 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CUL4AQ13619 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CUL4AQ13619 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CUL4AQ13619 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CUL4AQ13619 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CUL4AQ13619 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CUL4AQ13619 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CUL4AQ13619 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CUL4AQ13619 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CUL4AQ13619 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CUL4AQ13619 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CUL4AQ13619 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CUL4AQ13619 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CUL4AQ13619 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CUL4AQ13619 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CUL4AQ13619 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CUL4AQ13619 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CUL4AQ13619 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CUL4AQ13619 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CUL4AQ13619 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CUL4AQ13619 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CUL4AQ13619 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CUL4AQ13619 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CUL4AQ13619 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CUL4AQ13619 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CUL4AQ13619 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CUL4AQ13619 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CUL4AQ13619 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CUL4AQ13619 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CUL4AQ13619 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CUL4AQ13619 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CUL4AQ13619 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CUL4AQ13619 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CUL4AQ13619 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CUL4AQ13619 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CUL4AQ13619 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CUL4AQ13619 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CUL4AQ13619 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CUL4AQ13619 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CUL4AQ13619 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CUL4AQ13619 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CUL4AQ13619 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CUL4AQ13619 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CUL4AQ13619 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CUL4AQ13619 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CUL4AQ13619 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CUL4AQ13619 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CUL4AQ13619 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CUL4AQ13619 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CUL4AQ13619 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CUL4AQ13619 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CUL4AQ13619 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CUL4AQ13619 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CUL4AQ13619 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CUL4AQ13619 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CUL4AQ13619 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CUL4AQ13619 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
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