Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNA1Q09470 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNA1Q09470 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNA1Q09470 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNA1Q09470 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNA1Q09470 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNA1Q09470 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNA1Q09470 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNA1Q09470 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNA1Q09470 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNA1Q09470 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNA1Q09470 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNA1Q09470 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNA1Q09470 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNA1Q09470 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNA1Q09470 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNA1Q09470 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNA1Q09470 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNA1Q09470 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNA1Q09470 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNA1Q09470 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNA1Q09470 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNA1Q09470 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNA1Q09470 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNA1Q09470 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNA1Q09470 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNA1Q09470 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNA1Q09470 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNA1Q09470 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNA1Q09470 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNA1Q09470 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNA1Q09470 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNA1Q09470 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNA1Q09470 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNA1Q09470 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNA1Q09470 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNA1Q09470 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNA1Q09470 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNA1Q09470 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNA1Q09470 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNA1Q09470 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNA1Q09470 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNA1Q09470 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNA1Q09470 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNA1Q09470 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNA1Q09470 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNA1Q09470 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNA1Q09470 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNA1Q09470 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNA1Q09470 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNA1Q09470 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNA1Q09470 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNA1Q09470 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNA1Q09470 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNA1Q09470 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNA1Q09470 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNA1Q09470 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNA1Q09470 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNA1Q09470 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNA1Q09470 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNA1Q09470 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNA1Q09470 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNA1Q09470 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNA1Q09470 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNA1Q09470 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNA1Q09470 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNA1Q09470 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNA1Q09470 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNA1Q09470 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNA1Q09470 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNA1Q09470 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNA1Q09470 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNA1Q09470 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNA1Q09470 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNA1Q09470 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNA1Q09470 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNA1Q09470 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNA1Q09470 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNA1Q09470 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNA1Q09470 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNA1Q09470 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNA1Q09470 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNA1Q09470 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNA1Q09470 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNA1Q09470 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNA1Q09470 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNA1Q09470 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNA1Q09470 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNA1Q09470 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNA1Q09470 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNA1Q09470 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNA1Q09470 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNA1Q09470 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNA1Q09470 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNA1Q09470 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNA1Q09470 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNA1Q09470 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNA1Q09470 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNA1Q09470 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KCNA1Q09470 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms