Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
REG3AQ06141 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms