Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC18A2Q05940 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms